轮船圣安奴号位于枯叶市右侧的码头，玩家需先获得船票才能登船。船票需通过完成华蓝市正辉的支线任务获取，具体流程为：在华蓝市25号路尽头的研究所内，与变身为皮皮的科学家正辉对话，操作电脑帮助其恢复人形后获得。轮船是游戏中期推进剧情的关键场景，内含多个训练师对战和重要道具。
登船后需注意第二间客房可免费回复宝可梦状态，这是航行期间的重要补给点。船舱内部结构分为三层，底层需与劲敌小茂对战，顶层船长室可获得秘传机01居合斩。轮船会在玩家获得居合斩后自动离港，因此建议在离港前完成所有探索。调查右侧第二间客房的女孩可触发隐藏回复功能，该设计为后续版本轮船场景的经典复刻。
圣安奴号的机关设计具有早期版本特色，其中垃圾桶机关需连续触发两个正确开关才能开启道馆首领房间。该机制在枯叶市电系道馆中也有类似应用。轮船上的训练师等级集中在24-28级，建议队伍平均等级达到30级再进行挑战。战胜所有训练师可获得经验值与各类药剂，但不会重复刷新。
离开轮船后剧情将推进至11号道路，此处被卡比兽阻挡需后续获得宝可梦笛子才能继续。轮船事件链与七岛任务存在程序关联，部分玩家反映完成轮船任务后可能出现通信延迟，这属于原始版本的数据处理机制。游戏内时间系统不会影响轮船的停泊周期，任何时段前往码头均可触发登船事件。
该场景的BGM采用GBA特有的音轨压缩技术，音效采样率为32kHz。数据挖掘显示轮船地图占ROM容量约0.8MB，包含37个独立事件脚本。在3DS虚拟主机版本中，轮船甲板的波浪特效增加了垂直同步处理，但基础交互逻辑仍保持2004年原版设计。
若遇到无法登船的情况，建议检查是否已取得船票并完成华蓝市所有必要剧情。轮船场景的脚本错误在早期卡带版本中偶有出现，可通过重置内存或清理存档碎片解决。
