舟艇的选择直接影响水战效率和资源获取速度。船只改装是提升水上作战能力的关键环节，通过水寨系统可对船只进行特性调整。神行适用于快速行军，坚韧降低攻城体力消耗至11点，善水为非东吴阵营提供水战适应性保障，孤军和坚守则分别适合小规模战斗和驻守场景。改装效果需根据实战需求灵活切换，但每次调整需部队回城待命。水军适性通过武将操练提升，初始C级武将可通过消耗操练点逐步升至S级，每日战功获取上限为1500点，水寨每小时自然增长100点。
船只技术分为六类，需结合同盟战略和个人定位选择。掠敌可通过战斗获取资源，适合高活跃度玩家；焚舟针对连舫效果，是攻坚水军营地的核心指令；接舷缩短战斗时间并附带减伤，适合主力部队；御敌为团队提供士气回复和视野辅助，推荐工具人队伍使用；巡航适合时间有限的玩家自动挂机；渡江赋予隐身和先攻效果，但需谨慎评估触发条件。技术指令可随时更换，但需注意战场形势变化。
水上地图机制要求优先控制渡口和水军营地。部队仅能通过渡口进入水域，攻占后需层层推进至相邻水军营地。每格水路最多容纳20支船只，驻守无需占领地块。资源地需先夺取相邻水军营地方可占领，这种链式推进设计要求玩家精确规划进攻路线。东吴武将自带水性优势，其他阵营需通过善水改装或操练弥补适性差距。
运输船侧重载重与航速，适合资源运输；护卫舰平衡攻防属性，是常规水战选择；帆船提供远程火力支援但机动性较差。指挥官技能可增强船只特性，建议优先培养增加航速、命中或防御的被动技能。多人模式中建议组建混合舰队，8人联机时需明确分工主力作战与辅助船只。
初期建议将60%操练点用于提升主力武将适性，30%用于关键改装解锁，保留10%应对突发战术需求。战法点优先满足焚舟、掠敌等核心指令，剩余资源分配给接舷减伤效果。每日1500战功上限应确保完成，水寨自然增长点数为重要补充来源。这种分配模式能在资源有限前提下最大化水战收益。
